Se si collegano entrambi i Joy-Con al supporto Joy-Con, è possibile utilizzarli come un controller tradizionale. Senza il supporto, entrambi possono essere impiegati indipendentemente come due controller separati. I Joy-Con possono essere usati singolarmente in verticale o in orizzontale per giocare, ma è anche possibile giocare con un Joy-Con per mano. Immagina il Joy-Con come un bicchiere con cubetti di ghiaccio. Grazie alla vibrazione HD, mentre muovi il Joy-Con, senti i cubetti di ghiaccio muoversi nel bicchiere. La telecamera a infrarossi per il movimento del Joy-Con riconosce forme, movimenti e la distanza degli oggetti che la telecamera vede. Ad esempio, può riconoscere se una mano mostra carta, forbice o sasso. Con questa nuova funzione, ora sono disponibili più metodi di input che mai.