Il team di Star Fox torna trionfalmente con il remake di Star Fox 64 in pieno 3D, affrontando una delle sue missioni più grandi. L'intero universo di Star Fox si espande in modo realistico nelle profondità dello schermo del Nintendo 3DS, mentre la grafica 3D offre al giocatore una comprensione più chiara della distanza e della posizione. Questo rende il gioco più accessibile e intuitivo, permettendo ai giocatori di concentrarsi sull'azione. Star Fox 64 3D utilizza anche i due schermi del sistema Nintendo 3DS, con lo schermo superiore che mostra il gameplay 3D e lo schermo inferiore che presenta i vari personaggi e i loro dialoghi.