È un periodo di guerra. La Repubblica di Galbadia, sotto l'influenza della strega Edea, mobilita i suoi grandi eserciti contro le altre nazioni del mondo. Squall e altri membri di SeeD, un'elite di mercenari, si uniscono a Rinoa, una combattente della resistenza, per combattere contro il regime tirannico di Galbadia e per impedire a Edea di realizzare il suo obiettivo finale.