Il comando SEONZ ha inviato soldati d'élite e piloti in una semplice missione di ricognizione, scatenando così una guerra civile tra gli alieni. Ora, la non proprio felice banda di pirati si trova di nuovo nei guai. La loro nave aliena rubata inizia a disintegrarsi a migliaia di anni luce da casa, Skippy non mostra alcun segno di vita e, anche se dovesse essere riportato in vita, l'antica IA potrebbe non essere mai più la stessa.